MikroMondo erfüllt einen wichtigen Bildungsauftrag. Neben Tieren und Pflanzen sind Mikroorganismen die dritte große Gruppe im Konzert des Lebens, und das Wissen darüber ist nicht weit verbreitet.

Mit der Entwicklung von Ausstellungen und Science Centers stärkt MikroMondo den nachhaltigen Umgang mit Ressourcen (Luft, Wasser, Boden). Es fügt Neues in Bestehendes ein und stärkt die Sichtbarkeit von Wissenschaft und Forschung. MikroMondo setzt auf Langfristigkeit und auf Kooperation (Tourismus, biobasierte Industrien, Universitäten und Hochschulen). Vermittlungsangebote (Themenprogramme für Schulklassen und organisierte Gruppen), die kontinuierlich ausgebaut und weiterentwickelt werden, machen solche Ausstellungen für Stammgäste und Wiederholungstäter attraktiv.

• wie Mikroorganismen vom Menschen kultiviert und genutzt werden.
• wie Pilze als pflanzliche Symbiosepartner Bäume stärken.
• wie Pilze in landwirtschaftlich benachteiligten Regionen Furore machen.
• warum Pilze, die in Symbiose mit Algen zu Flechten werden, wichtige Bioindikatoren für Luftgüte sind.
• wie man Algen zur Gewinnung wertvoller Produkte nutzen kann.
• dass Mikroorganismen auf und in Gletschern und Ciliaten in unseren Gewässern leben.
• dass es in den Alpen pilzzüchtende Ameisen gibt.
• wie Mikroben Pilze, Bakterien und gar Holz leuchten lassen.
• warum Wiederkläuer Bakterien, Pilze und Archaeen zur Verdauung brauchen.
• wie das menschliche Mikrobiom zur Gesundheit beiträgt.
• wie Bakterien unser Abwasser reinigen.
• wie Antibiotikaresistenzen entstehen und was das mit naturnaher Landwirtschaft zu tun hat.
• wie Mikroorganismen lokale Spezialitäten wie Bier, Wein, Käse und Joghurt erzeugen.
• wie Abwasser zur Gesundheitsvorsorge beitragen kann.

• Magneten für naturwissenschaftlich interessierte Besucher und Besucherinnen zu sein.
• außerschulische Lehr- und Lernorte für einen hochaktuellen Bereich der Biologie zu sein.
• Weiterbildungsmöglichkeiten für LehrerInnen zu bieten.
• Ort der Verwirklichung für Studierende des Bachelor Biologie und aller naturwissenschaftlichen Master- und Lehramtsstudierende zu werden.
• das Bewusstsein für qualitätsvolles Wasser, sowie den sorgsamen Umgang mit Ressourcen zu erhöhen.
• das Bewusstsein zu wecken, wie sehr Mikroorganismen unser Leben mitbestimmen.
• das Wechselspiel zwischen Mikroben und Menschen zu vermitteln.

• Menschen, die Neues und Zukunftsorientiertes suchen und ihr Wissen um die Welt der Mikroben erweitern wollen.
• Institutionen der Weiterbildung und Wissenschaftsvermittlung
• Gesundheits- und Naturschutzorganisationen und -Behörden
• Tourismus  der Besuchern was anderes bieten will als Sonne, Seen, Berge und Kultur
• Firmen die von Mikroorganismen leben: Pharmafirmen, Brauereien, Pilzproduzenten, Pizzahersteller, Bäckereien, Abwasser- und Abfallbehandler, Hygieneanbieter
• Analyselabors, Umweltechnikanbieter und -ingenieurbüros
• SchülerInnen der Volks- und weiterbildenden Schulen die sich laut Lehrplan mit mikrobiologischen Themen auseinandersetzen sollen.
• Lehrende die oft fachliche Unsicherheiten bezüglich Mikroorganismen haben